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品質不良なミトコンドリアの蓄積は、ミトコンドリアの機能不全を引き起こし、がん・神経変性疾患・老化をはじめとした様々な疾患や病態の原因となる。しかしながら、ミトコンドリアの品質管理がどのように行われているかは、永らく不明であった。分野長の荒川は長年p53標的遺伝子研究に取り組み、細胞死やDNA修復、血管新生抑制などに関わる遺伝子を同定し報告してきた(Cell 2000, Nature 2000, Mol Cell 2001, Nature Cell Biol 2003, Nature Genet 2003, Nature Rev Cancer 2004, Nature Genet 2007, Cancer Res 2007)。この一連の研究の中で、最も重要なp53標的遺伝子としてMieap 遺伝子を発見し、p53のがん抑制機能として全く新しいメカニズムを発見するに至った(図1)(PLOS ONE 2011)(実験医学、2019年)。

図1.がん抑制遺伝子p53の標的遺伝子としてMieapを発見した

最終的に明らかになった本機能のメカニズムは、Mieapタンパク質がミトコンドリアに液滴(Liquid droplets)を形成し、このMieap液滴が非膜オルガネラ(Membrane-less organelles: MLOs)としてミトコンドリア特異的脂質であるカルジオリピン(Cardiolipin: CL)の代謝反応を区画化し、促進しているというものであった(図2)(iScience 2024)(医学のあゆみ、2022年)。

図2.Mieapはミトコンドリアに液滴を形成しカルジオリピン代謝を促進することでがんを抑制している

液滴とはタンパク質の濃縮体で、細胞内の環境・条件に応じて、液体との間でその状態を可逆的に変化させることが出来る。重要なことは、この液滴は単なるある単一タンパク質の濃縮状態なのではなく、「数十から数百種類のタンパク質や核酸などの分子を含有した状態」になっており、内部にはある特定の反応に関与する複数の基質と酵素及び反応中間体が濃縮しており、その一連の酵素反応系を促進させる働きを有していることである(図3)。我々が見出したこのMieap液滴は、ミトコンドリア内に形成される液滴で、カルジオリピン代謝の生合成反応とリモデリング反応を促進している非膜オルガネラであった(細胞、2022年)(Droplets of life, 2022年, Elsevier)。

図3.液滴は代謝連続反応を区画化し酵素や基質を濃縮することで酵素反応を促進する

一方でカルジオリピンとは、細胞内で唯一ミトコンドリア固有のリン脂質であり、ミトコンドリアの内膜に存在する(医学のあゆみ、2022年)。カルジオリピンは1分子に4本足の脂肪酸を有しているため極めてユニークな、cone-shapedと呼ばれる、バトミントンのシャトルのような円錐形の形態をとる(図4)。

図4.カルジオリピンはミトコンドリア内膜に特異的なリン脂質である

この性質はミトコンドリア内膜クリステの屈曲した形態や構造の構築に重要である(図5)。

図5.カルジオリピンはミトコンドリアのクリステ構造形成に重要である

また強く負に荷電した極性頭部と足側の4つの脂肪酸鎖の疎水性結合により、数多くのミトコンドリア膜関連タンパク質と結合し、それらタンパク質の足場となって安定化し機能の発現に重要である。特に呼吸鎖においては複合体I、II、III、IV、Vのそれぞれに対して2分子から4分子のカルジオリピンが結合し、呼吸鎖タンパク質の足場となり各複合体を互いに近接させ、超複合体を形成することで、電子伝達系の効率が高まり、ATP合成活性が上昇するとともに活性酸素種(ROS)の発生が減少する(図6)。逆にカルジオリピンが異常になると、電子伝達系の効率が下がり、ATP合成活性が低下し、ROSの発生が増加する(図6)。

図6.カルジオリピン代謝を人為的に促進することで様々な疾患の予防・治療が可能になる

以上より長年不明であったMieapによるミトコンドリア品質管理のメカニズムは、Mieap液滴が非膜オルガネラとしてミトコンドリアでカルジオリピン代謝を促進させることで、カルジオリピンの量的・質的な健常性を維持することと考えられる。この機能はタンパク質分解によるプロテオスタシスやオルガネラ分解によるオートファジーに続く第3のミトコンドリア品質管理機構である。

様々ながん種の患者検体を用いた「臨床がんレベルの解析」から、大腸がん・胃がん・乳がんなどのがん組織において、本機能は高頻度に不活性化されていた(Oncogenesis 2016, Cancer Sci 2018, BBRC 2020, Am J Cancer Res 2022)。また「個体レベルの解析」から、Mieap欠損ApcMin/+マウスの小腸及び大腸においては消化管腫瘍の顕著な発生数の増加や腫瘍の悪性化・がん化の著しい促進が認められた(Sci Rep 2015)。さらに、ヒト大腸がん組織とMieap欠損ApcMin/+マウスの腫瘍においては、ともに共通した「球形でクリステ構造が顕著に減少した形態異常を呈するミトコンドリアの集積」を認めた。この形態異常は、カルジオリピン代謝酵素の異常から発症するBarth症候群の患者検体に見られる異常ミトコンドリアに酷似している。

がん細胞ではp53やMieapの破綻によってカルジオリピン代謝抑制が生じ、クリステ構造が減少・消失した異常ミトコンドリアが集積している(図5)(がん分子標的治療、2017年)。がんに特徴的な代謝特性であるワールブルグ効果は、がんのカルジオリピン代謝抑制の結果である可能性がある(医学のあゆみ、2022年)。この「がん細胞特異的に集積した異常ミトコンドリア」が、がんの発生・悪性化・増殖・浸潤・転移におけるdriving forceとして働いていると考えられる。

足場タンパク質であるMieapは単独で非膜オルガネラの形成を駆動でき、生体内でのカルジオリピン代謝活性化が可能になる。我々が世界に先駆けて発見した非膜オルガネラによって制御されるカルジオリピン代謝反応をがん組織で特異的に活性化することで、がんの異常ミトコンドリアを標的としたがんの予防・治療法の開発が可能になると期待される(図6)。

参考文献


  1. Ikari N, Honjo K, Sagami Y, Nakamura Y, Arakawa H. Mieap forms membrane-less organelles involved in cardiolipin metabolism. iScience. Vol.27: 108916. (2024)
    https://doi.org/10.1016/j.isci.2024.108916 [ PubMed ]
  2. Ikari N, Arakawa H. Identification of a mitochondrial targeting sequence in cathepsin D and its localization in mitochondria. Biochemical and Biophysical Research Communications. Vol.655: 25-34 (2023) [Times Cited: 1] [PubMed]
  3. Arakawa H. MLOs and control of metabolic pathways. Uversky V. Droplets of life. Elsevier. Chapter 14. 431-446. (2023)
    https://doi.org/10.1016/B978-0-12-823967-4.00023-3
  4. 荒川 博文.「がんの細胞死回避戦略としてのワールブルグ効果とカルジオリピン代謝を制御するMieap液滴について」 医学のあゆみ.283 No.5: 469-479. (2022)
  5. Hamada K, Kurashige T, Shimamura M, Arakawa H, Nakamura Y, Nagayama Y. MIEAP and ATG5 are tumor suppressors in a mouse model of BRAFV600E-positive thyroid cancer. Frontiers in Endocrinology. 13 : 932754. (2022) [PubMed]
  6. 碇 直樹、 荒川 博文.「Mieap液滴が制御するカルジオリピン代謝連続反応のメカニズム」細胞. Vol.54 No.8 : 39-43. (2022)
  7. Futamura M, Tokumaru Y, Takabe K, Arakawa H, Asano Y, Mori R, Mase J, Nakakami A, Yoshida K. MIEAP, a p53-downstream gene, is associated with suppression of breast cancer cell proliferation and better survival. Am J Cancer Res. 11(12) : 6060-6073. (2021) [Times Cited: 3] [PubMed]
  8. Sano H, Futamura M, Gaowa S, Kamino H, Nakamura Y, Yamaguchi K, Tanaka Y, Yasufuku I, Nakakami A, Arakawa H, Yoshida K. p53/Mieap-regulated mitochondrial quality control plays an important role as a tumor suppressor in gastric and esophageal cancers. Biochemical and Biophysical Research Communications. 529 : 582-589. (2020) [Times Cited: 7] [PubMed]
  9. 荒川 博文.「Mieapが誘導する液滴とミトコンドリア制御―損傷ミトコンドリアの液-液相分離によるp53がん抑制作用について」.実験医学.37 : 1977 – 1986. (2019)
  10. Gaowa S, Futamura M, Tsuneki M, Kamino H, Tajima JY, Mori R, Arakawa H, Yoshida K. Possible role of p53/Mieap-regulated mitochondrial quality control as a tumor suppressor in human breast cancer. Cancer Science. 109: 3910-3920 (2018) [Times Cited: 14] [PubMed]
  11. 中村康之 常木雅之 荒川博文.「がん特異的異常ミトコンドリアを標的とした新しい診断・治療法の開発について」.がん分子標的治療.15巻2号:66-71(2017)
  12. Nakamura Y and Arakawa H. Discovery of Mieap-regulated mitochondrial quality control as a new function of tumor suppressor p53. Cancer Science. 108: 809-817. (2017) [Times Cited: 28] [PubMed]
  13. Kamino H, Nakamura Y, Tsuneki M, Sano H, Miyamoto Y, Kitamura N, Futamura M, Taniguchi H, Kanai Y, Shida D, Kanemitsu Y, Moriya Y, Yoshida K, Arakawa H. Mieap-regulated mitochondrial quality control is frequently inactivated in human colorectal cancer. Oncogenesis. 5: e181 (2016). [Times Cited: 23] [Mieapのヒト臨床がん(大腸がん症例)での重要性を初めて報告した][Pubmed]
  14. Tsuneki M, Nakamura Y, Kinjo T, Nakanishi R, Arakawa H. Mieap suppresses murine intestinal tumor via its mitochondrial quality control. Scientific Reports. 5: 12472 (2015). [Times Cited: 23] [Mieapの個体レベル(大腸がんモデルマウス)での重要性を初めて報告した][Pubmed]
  15. 荒川博文. 「p53誘導性蛋白質Mieapによる新規ミトコンドリア品質管理機構 ― がん抑制遺伝子p53の新しい機能」. 医学のあゆみ. 250: 505-510 (2014).
  16. Miyamoto T, Kitamura N, Ono M, Nakamura Y, Yoshida M, Kamino H, Murai R, Yamada T, Arakawa H. Identification of 14-3-3gamma as a Mieap-interacting protein and its role in mitochondrial quality control. Scientific Reports. 2: 379 (2012). [Times Cited: 14][Pubmed]
  17. Nakamura Y, Kitamura N, Shinogi D, Yoshida M, Goda O, Murai R, Kamino H, Arakawa H. BNIP3 and NIX mediate Mieap-induced accumulation of lysosomal proteins within mitochondria. PLoS ONE. 7: e30767 (2012). [Times Cited: 48][Pubmed]
  18. 荒川博文. 「ミトコンドリア品質管理のメカニズムとがん」. 実験医学. 30: 1407-1417 (2012).
  19. Kitamura N, Nakamura Y, Miyamoto Y, Miyamoto T, Kabu K, Yoshida M, Futamura M, Ichinose S, Arakawa H. Mieap, a p53-inducible protein, controls mitochondrial quality by repairing or eliminating unhealthy mitochondria. PLoS ONE. 6: e16060 (2011). [Times Cited: 85][Pubmed]
  20. Miyamoto Y, Kitamura N, Nakamura Y, Futamura M, Miyamoto T, Yoshida M, Ono M, Ichinose S, Arakawa H. Possible existence of lysosome-like organella within mitochondria and its role in mitochondrial quality control. PLoS ONE. 6: e16054 (2011). [Times Cited: 72] [Mieap発見の発表論文でありF1000で高い評価を受けた][Pubmed]
  21. 荒川博文. 「p53によるオートファジーの制御」. 実験医学. 23: 397-403 (2010).
  22. Futamura M, Kamino H, Miyamoto Y, Kitamura N, Nakamura Y, Ohnishi S, Masuda Y, Arakawa H. Possible role of semaphorin 3F, a candidate tumor suppressor gene at 3p21.3, in p53-regulated tumor angiogenesis suppression. Cancer Research 67: 1451-1460 (2007). [Times Cited: 88][Pubmed]
  23. Bourdon A, Minai L, Serre V, Jais JP, Sarzi E, Aubert S, Chretien D, de Lonlay P, Paquis-Flucklinger V, Arakawa H, Nakamura Y, Munnich A, Rotig A. Mutation of RRM2B, encoding p53-controlled ribonucleotide reductase (p53R2), causes severe mitochondrial DNA depletion. Nature Genetics. 39: 776-780 (2007). [Times Cited: 465][Pubmed]
  24. Arakawa H. p53, apoptosis and axon-guidance molecules. Cell Death and Differentiation. 12: 1057-1065 (2005). [Times Cited: 65][Pubmed]
  25. Arakawa H. Netrin-1 and its receptors in tumorigenesis. Nature Reviews Cancer. 4: 978-987 (2004). [Times Cited: 234][Pubmed]
  26. Yoon KA, Nakamura Y, Arakawa H. Identification of ALDH4 as a p53-inducible gene and its protective role in cellular stresses. Journal of Human Genetics. 49: 134-140 (2004). [Times Cited: 207][Pubmed]
  27. 荒川博文. 「p53によるアポトーシス制御とその新展開」. 実験医学. 22時14分95-1501 (2004).
  28. 荒川博文. 「癌抑制遺伝子p53とその標的遺伝子群」. 医学のあゆみ. 211: 215-217 (2004).
  29. Kimura T, Takeda S, Sagiya Y, Gotoh M, Nakamura Y, Arakawa H. Impaired function of p53R2 in Rrm2b-null mice causes severe renal failure through attenuation of dNTP pools. Nature Genetics. 34: 440-445 (2003). [Times Cited: 141][Pubmed]
  30. Tanikawa C, Matsuda K, Fukuda S, Nakamura Y, Arakawa H. p53RDL1 regualtes p53-dependent apoptosis. Nature Cell Biology. 5: 216-223 (2003). [Times Cited: 159][Pubmed]
  31. Ueda K, Arakawa H, Nakamura Y. Dual-specificity phosphatase 5 (DUSP5) as a direct transcriptional target for tumor suppressor p53. Oncogene 22: 5586-5591 (2003). [Times Cited: 113][Pubmed]
  32. Ng CC, Arakawa H, Fukuda S, Kondoh H, Nakamura Y. p53RFP, a p53-inducible RING-finger protein, regulates the stability of p21WAF1. Oncogene 22: 4449-4458 (2003). [Times Cited: 47][Pubmed]
  33. 荒川博文、中村祐輔. 「転写因子p53によって制御される遺伝子群」. 細胞工学. 22: 23-28 (2003).
  34. Iiizumi M, Arakawa H, Mori T, Ando A, Nakamura Y. Isolation of a novel gene, CABC1, encoding a mitochondrial protein that is highly homologous to yeast activity of bc1 complex. Cancer Research. 62: 1246-1250 (2002). [Times Cited: 48][Pubmed]
  35. Mori T, Anazawa Y, Iiizumi M, Fukuda S, Nakamura Y, Arakawa H. Identification of the interferon regulatory factor 5 gene (IRF-5) as a direct target for p53. Oncogene. 21: 2914-2918 (2002). [Times Cited: 138][Pubmed]
  36. Matsuda K, Yoshida K, Nakamura K, Nakamura Y, Arakawa H. p53AIP1 regulates the mitochondrial apoptotic pathway. Cancer Research. 62: 2883-2889 (2002). [Times Cited: 115][Pubmed]
  37. Yamaguchi T, Matsuda K, Sagiya Y, Iwadate M, Fujino AJ, Nakamura Y, Arakawa H. p53R2-dependent pathway for DNA synthesis in a p53-regulated cell cycle checkpoint. Cancer Research. 61: 8256-8262 (2001). [Times Cited: 143][Pubmed]
  38. Okamura S, Arakawa H, Tanaka T, Nakanishi H, Ng CC, Taya Y, Monden M, Nakamura Y. p53DINP1, a p53-Inducible Gene, Regulates p53-Dependent Apoptosis. Molecular Cell. 8: 85-94 (2001). [Times Cited: 320][Pubmed]
  39. 荒川博文、中村祐輔. 「転写因子p53とそのターゲット遺伝子群」. 実験医学. 19: 1050-1056 (2001).
  40. Shiraishi K, Fukuda S, Mori T, Matsuda K, Yamaguchi T, Tanikawa C, Ogawa M, Nakamura Y, Arakawa H. Identification of fractalkine, a CXC3-type chemokine, as a direct target of p53. Cancer Research. 60: 3722-3726 (2000). [Times Cited: 58][Pubmed]
  41. Oda K, Arakawa H, Tanaka T, Matsuda K, Tanikawa C, Mori T, Nishimori H, Tamai K, Tokino T, Nakamura Y, Taya Y. p53AIP1, a potential mediator of p53-dependent apoptosis, and its regulation by Ser46-phosphorylated p53. Cell. 102: 849-862 (2000). [Times Cited: 1,135][Pubmed]
  42. Tanaka H, Arakawa H, Yamaguchi T, Shiraishi K, Fukuda S, Matsui K, Takei Y, Nakamura Y. A ribonucleotide reductase gene involved in a p53-dependent cell cycle checkpoint for DNA damage. Nature. 404: 42-49 (2000). [Times Cited: 839][Pubmed]